На базе Альфа, Сэм Картер и Селмак (симбионт Джейкоба отца Картер) работают над новым оружием против новых супер-солдат Анубиса, когда планета подвергается атаке флота кораблей гоа’улдов. Картер успевает уйти с прототипом оружия до активации самоуничтожения, но ее преследует супер-солдат Анубиса.